اقترح أول مفهوم البروتيوم من قبل مارك ويلكنز. وهو يشير إلى جميع البروتينات التي يعبر عنها الجينوم (الجينوم)، أو خلية أو نسيج. مفهوم البروتيوم لديه العديد من الاختلافات مع مفهوم الجينوم. المنظمة وحتى حالة البيئة تتغير. أثناء النسخ، يمكن أن يتم فصل الجين في أشكال متعددة من الحمض النووي الريبي الريبي ( mRNA). البروتيوم ليس منتجاً مباشراً للجينوم. عدد البروتينات في البروتيوم يمكن أن يتجاوز في بعض الأحيان عدد الجينوم. البروتيوميكس في مرحلة مبكرة "التنمية" الدولة. وينكر الخبراء في هذا المجال أنها منهجية محضة. تماما مثل الجينوم ، فإنه ليس نظام المعرفة مغلقة ، تصوري ومستقر ، ولكن حقلا.
